南京大学软件学院的办学定位：“软件学院是南京大学所属的教学研究型工科学院。学院实行企业化管理，注重工程技术研究与开发，面向世界、面向社会、面向市场培养多层次复合型高素质的软件实用人才。”

　　南京大学软件学院立足于培养具有国际竞争能力的高素质复合型软件实用人才，立足于为中国民族软件产业振兴培养对国际软件产业认知的高水平工程人才。学院在以下五个方面已经形成或正在形成创新点：

　　● 一个与国际市场需求接轨的产学研相结合的软件实用人才培养模式。
　　● 一个理论教学、技能培训和工程实践相结合的教学模式。
　　● 一个体现学科发展趋势和满足软件产业需求的课程体系。
　　● 一个符合教育体制改革导向的学院管理模式。
　　● 一个面向社会的科技开发和科技服务体系。